牡丹江师范学院和牡丹江大学两所学校都位于黑龙江省牡丹江市，属于同城高校，而且两所学校距离也不远，走路也就五分钟，开车也就一分钟的路程。两所学校的教研领域大为不同，牡丹江师范学院是以师范为主的高校；牡丹江大学则是一所综合性院校。
牡丹江大学，是一所公办高校，但是属于专科办学层次的院校，这一点同“大学”命名规则不符，属于历史遗留问题。牡丹江大学，创办于年，当时国内高等教育管理下放地方，各地都兴办了各类高校，其实都属于专科学校，但是很多地方为了“面子”，将其命名“大学”，而牡丹江大学就是在这个大背景下成立的高校。国内高校命名规则，事实上是八十年代末才开始逐渐推广，所以牡丹江大学，在当时来讲也不算违规，属于历史遗留问题。
牡丹江大学，建校初期，同国内大多数此类“大学”一样，班底实力都极差，都是为了高考扩招和解决劳动力就业问题，而临时起意，创办的高校，所以建校班底实力都非常弱。牡丹江大学，建校之初，属于“零基础”既没有人员，也没有教学设备和教研设施，学生都是以委托培养为主。当时，招生的同时，还需要负责安排工作，为此牡丹江大学还要联系市内各大局，落实毕业生工作的时期，真是一穷二白起家的学校。
牡丹江师范学院，前身是东北农学院嫩江分院，是农林类起家的学校，后来改建为师范类高校，因为当时政策要求，各个地级市都要有师范类学校，以保证基础教育人才建设，所以成立了这所学校。总体来看，牡丹江师范学院的实力胜过牡丹江大学一些，毕竟两所学校都是公办高校，而牡丹江师范学院又是一所本科院校，自然要比牡丹江大学实力更强了。
